Το Amazon φιλοξενεί πληροφορίες ανθρώπινων γονιδίων για τις ανάγκες έρευνας

[dimitris2006]

To Amazon Web Services το οποίo προσφέρει υπηρεσίες στο “σύννεφο” ανακοίνωσε ότι θα διαθέσει ορισμένους από τους πόρους της για τη συλλογή δεδομένων του “1,000 Genomes Project”, μια διεθνή προσπάθεια κατηγοριοποίησης της γενετικής πληροφορίας από δωρητές όλου του κόσμου. Η Amazon πρόκειται να διαθέσει 200 terrabytes πληροφορίας για τις ανάγκες του έργου, αλλά θα χρεώνει τους ερευνητές σε περίπτωση που θα χρειαστούν να αναλύσουν τα δεδομένα που συλλέγουν.

Μέχρι σήμερα υπάρχουν συγκεντρωμένα περίπου 1700 δείγματα DNA, τα οποία όμως βρίσκονται αποθηκευμένα σε διαφορετικές τοποθεσίες. Έτσι η Amazon προτίθεται να τα συγκεντρώσει όλες τις πληροφορίες στους υπολογιστές της, δίνοντας επιπλέον τη δυνατότητα επεξεργασίας τους από τους επιστήμονες.

 

Ανεβάζοντας τα δεδομένα στο Cloud δίνεται η τεράστια δυνατότητα για τους ερευνητές όλου του κόσμου να εξετάσουν γενετική πληροφορία, συγκεντρωτικά από ένα μεγάλο αριθμό δειγμάτων. Οι υπηρεσίες της εταιρείας για επεξεργασία των δεδομένων που μπορούν είναι το Amazon Elastic Compute Cloud και το Amazon Elastic MapReduce.

 

Site: theverge.com

[oneofthem]

πολύ καλό αν και εγείρονται ερωτήματα για τυχόν συμφωνίες για τα δικαιώματα εκμετάλλευσης των πληροφοριών και αποτελεσμάτων αυτών των ερευνών μελλοντικά, από τη στιγμή που αρχίζουν να εμπλέκονται διεθνείς επενδυτικές εταιρείες όπως αυτές της πληροφορικής και ηλεκτρονικών

[Lomar]

Πάλι η google την πρόλαβε:

 

http://23andme.com/

[xpapias]

Από τη στιγμή που "προσφέρω" τη γενετική μου πληροφορία, γιατί να υπάρχει κάποιος που την εκμεταλλεύεται οικονομικά;;;!

[Meraklis56]

άνθρωπος: το πρώτο όν το οποίο χρεώνει την εξέλιξη του.

[21century]

Πολυ καλη πρωτοβουλία...

[BozGNR]

μοριακός βιολόγος και γενετιστής εδώ. αν υπάρχουν απορίες, ελεύθερα!

[aiolos.01]

Καλή (επιχειρηματική) κίνηση. Προσφέρει δωρεάν χώρο για τα data και όποιος θέλει να τα επεξεργαστεί πληρώνει. Μπορεί βέβαια να τα πάρει και να τα επεξεργαστεί κάπου αλλού, αλλά οι περισσότεροι θα προτιμήσουν την ευκολία που τους προσφέρει η amazon. Έτσι βγάζουν κέρδος και απο τη "δωρεαν" προσφορά.

[Lomar]

Από τη στιγμή που "προσφέρω" τη γενετική μου πληροφορία, γιατί να υπάρχει κάποιος που την εκμεταλλεύεται οικονομικά;;;!

 

και οι υπηρεσίες/διευκολύνσεις που προσφέρει στους ερευνητές η amazon, πως θα καλυφθούνε;

 

αν είναι καλό για την ανθρωπότητα και όχι απλά ακόμα ένα προϊόν/υπηρεσία, εξαρτάται απο το κόστος της ανάλυσης των δεδομένων, συναρτήσει του κόστους για την ίδια ανάλυση στον ίδιο χρόνο, απο τον εξοπλισμό και τους η/υ που έχουν ήδη στη διάθεσή τους, ή κάποιας άλλης εναλλακτικής λύσης, οι ερευνητές.

 

πάντοτε χρειάζονται χρήματα για έρευνα, καμία έρευνα δεν είναι ανέξοδη, το ζήτημα είναι αν η amazon με το cloud της γλυτώνει ρεύμα ή και χρόνο απο τους ερευνητές, τότε μιλάμε για θετική εξέλιξη και όχι απλά για μια εξειδικευμένη διευκόλυνση.

 

μοριακός βιολόγος και γενετιστής εδώ. αν υπάρχουν απορίες, ελεύθερα!

 

αγαπητέ συνφορουμίτη έχω απορία τσέκαρε τι έγραψα πάνω απο τη παράθεση που σου έκανα και πες μας αν αξίζει και μέσα σε ποιά πλαίσια η χρέωση ενός ερευνητή για ανάλυση δεδομένων της τάξης των 200tb.

 

Amazon will be footing the bill to host the roughly 200 terabytes of information, but will charge researchers to use its cloud computers if they want to analyze specific sets of data.

κάτι ακόμα, μια και σε βρήκαμε βολικό , κατα πόσο είναι εύκολο και σε τι βάθμο είναι δυνατή η πρόσβαση για έναν ανεξάρτητο πανεπιστημίου ερευνητή σε παρόμοια δεδομένα τέτοιου όγκου;

[BozGNR]

 

και οι υπηρεσίες/διευκολύνσεις που προσφέρει στους ερευνητές η amazon' date=' πως θα καλυφθούνε;

 

αν είναι καλό για την ανθρωπότητα και όχι απλά ακόμα ένα προϊόν/υπηρεσία, εξαρτάται απο το κόστος της ανάλυσης των δεδομένων, συναρτήσει του κόστους για την ίδια ανάλυση στον ίδιο χρόνο, απο τον εξοπλισμό και τους η/υ που έχουν ήδη στη διάθεσή τους, ή κάποιας άλλης εναλλακτικής λύσης, οι ερευνητές.

 

πάντοτε χρειάζονται χρήματα για έρευνα, καμία έρευνα δεν είναι ανέξοδη, το ζήτημα είναι αν η amazon με το cloud της γλυτώνει ρεύμα ή και χρόνο απο τους ερευνητές, τότε μιλάμε για θετική εξέλιξη και όχι απλά για μια εξειδικευμένη διευκόλυνση.

 

αγαπητέ συνφορουμίτη έχω απορία τσέκαρε τι έγραψα πάνω απο τη παράθεση που σου έκανα και πες μας αν αξίζει και μέσα σε ποιά πλαίσια η χρέωση ενός ερευνητή για ανάλυση δεδομένων της τάξης των 200tb.

 

κάτι ακόμα, μια και σε βρήκαμε βολικό <img src='http://www.insomnia.gr/public/style_emoticons/<#EMO_DIR#>/tongue.gif' class='bbc_emoticon' alt='' />, κατα πόσο είναι εύκολο και σε τι βάθμο είναι δυνατή η πρόσβαση για έναν ανεξάρτητο πανεπιστημίου ερευνητή σε παρόμοια δεδομένα τέτοιου όγκου;[/quote']

 

συμφωνώ σε κάθε γραμμή. καμία έρευνα δεν είναι ανέξοδη. Αυτο που θα ήθελα να προσθέσω κ να επισημάνω είναι οτι η κλίμακα της συγκεκριμένης ερευνητικής δραστηριότητας (1000 genomes) είναι τόσο μεγάλη, που τα δεδομένα που προκύπτουν (200 tb) δεν μπορει να τα διαχειριστεί ο υπολογιστής του εργαστηρίου. Είναι περίπτωση παρόμοια με αυτη του CERN. Η υπολογιστική ισχύς που απαιτείται για την επεξεργασία των πειραματικών δεδομένων τους είναι τάξεις μεγέθους μεγαλυτερη από αυτη ενός desktop. Η amazon προσφέρει μια καλή λύση κ πολυ πιο οικονομική απο το να στήσουν τα εν λόγω ερευνητικα κέντρα τους δικούς τους servers, data centers κλπ. Είναι πρακτικά αδύνατο κ οικονομικά ασύμφορο να γίνει επεξεργασία αυτών των δεδομένων χωρίς τη βοήθεια κάποιου "εταίρου"..

 

και κάτι ακόμη για την ιστορία! πριν απο δέκα χρόνια για να αναλύσει κάποιος το γονιδίωμα ενός ανθρώπου χρειάστηκαν δέκα+ ολόκληρα χρόνια και περίπου 3 δις δολάρια. πλέον η ίδια δουλεια απαιτεί λιγότερα απο χίλια δολάρια και το πολυ μια μέρα. φανταστείτε τους αλματώδεις ρυθμούς με τους οποίους προχωράει η τεχνολογία.. βέβαια τα δεδομένα που προκύπτουν απο την ανάλυση ενός γονιδιωματος είναι ίδια, όχι μικρότερα. το ανθρώπινο γονιδίωμα, οι οδηγίες δηλαδη για να "φτιαχτεί" ένας άνθρωπος, έχουν μέγεθος 3 δις "ψηφια". Δηλαδη περίπου 3 gb. Αλλά για να διαβάσεις αξιοπιστα το ανθρώπινο γονιδίωμα πρέπει να το κανείς πολλές φορές κ να βγάλεις το average, άρα τα 3 gb πολλαπλασιάζονται.. έτσι φτάνουμε να μιλάμε για 200 tb!!

 

Sent from my iPod touch using Insomnia