Είναι μεγάλη η διαφορά τους. Τα PDF μιμούνται τη σελίδα του τυπωμένου βιβλίου (ή περιοδικού κλπ). Είναι σα να έχεις ένα ακριβές, σκαναρισμένο αντίγραφο σε ψηφιακή μορφή. Γι' αυτή το κείμενο και σελίδα δε χωράνε ακριβώς σε μια οθόνη. Παραμένουν τα ίδια ανεξάρτητα από την οθόνη και γι' αυτό χρειάζεται να κάνουμε ζουμ.
Το ePUB είναι έτσι φτιαγμένο ώστε να προσαρμόζεται πλήρως το περιεχόμενο στην οθόνη που έχουμε, όσο μικρή και αν είναι αυτή (π.χ. ενός κινητού). Μεγαλώνουμε ή μικραίνουμε τα γράμματα, επιλέγουμε απόσταση γραμμών και περιθώρια ή το είδος της γραμματοσειράς και πάλι το κείμενο χωράει ακριβώς στη διαθέσιμη οθόνη και το μόνο που έχουμε να κάνουμε είναι να πατάμε επόμενη ή προηγούμενη σελίδα. Δε χρειάζεται ζουμ. Για να το δεις και στην πράξη, μπορείς να παρακολουθήσεις κάποια από τα βίντεο που έχω.
Σημειώνω, για να είμαστε δίκαιοι με το PDF, ότι σε κάποιες συσκευές (όπως στους Sony Reader) υπάρχει reflow και για τα PDF κειμένου (όχι τα σκαναρισμένα χωρίς OCR), δηλαδή μπορούμε να αυξομειώσουμε το μέγεθος των γραμμάτων και να έχουμε νέα σελιδοποίηση. Αλλά αυτή η διαδικασία, επειδή πρόκειται για PDF και όχι ePUB, χαλάει τη μορφοποίηση του εγγράφου.